La creación de la embarcación para la película requirió meses de trabajo y mucho estudio. Sabiamos que crear un Arca con imágenes generadas por computadora seria mucho mas sencillo, pero eso no transmitiría a los cinéfilos la emoción de experimentar la enormidad del proyecto. Afirmo Darren Aronofsky director del Film «Nuestra idea fue basarnos en lo que dice la Biblia y ésta describe el Arca como un rectángulo, una caja», explica Aronofsky. La narración del Génesis da especificaciones detallada para las dimensiones del Arca, es uno de los pocos lugares en el cual se dan instrucciones increíbles.
Aronofsky se apegó estrechamente a este texto y lo usó para el diseño de la embarcación. «Todas las versiones que hemos visto en los últimos 100 años han mostrado barcos, pero en realidad el Arca no necesitaba una quilla (Pieza más importante de la estructura sobre la que se construye un barco) El barco no debía navegar. Sólo flotaría durante la inundación. Así que acudimos a la Biblia y construimos el Arca con el alcance descripto ahí, que es de enormes dimensiones». Se construyó casi un tercio del Arca que medía unos 50 metros.
Para diseñar y construir el Arca Aronofsky colaboró cercanamente con el diseñador de producción Mark Friedberg, ganador de un Emmy por Mildred Pierce, de HBO.
Una vez que terminaron los diseños, la construcción se inició en Long Island. En un campo de pasto que se suele usar como estacionamiento, el equipo trabajó en el Arca durante cinco meses. Los cientos de integrantes del equipo de Friedberg construyeron casi un tercio, pero el resto fue completado por el área de efectos visuales en la posproducción.
El interior del Arca se estableció en tres niveles, como está escrito en el Génesis. «El nivel inferior es la cubierta para los mamíferos más altos, como mamuts, elefantes, jirafas y bestias gigantes. Los reptiles e insectos vivían en el nivel medio, que tenía sólo ocho pies de altura, mientras que el nivel superior era la Cubierta Aviar, donde vivía la familia con todas las aves», describe Friedberg.