Al inicio de 2020, los científicos secuenciaron el genoma del virus, el SARS-CoV-2, pero aún seguían sin conocerse muchos genes codificadores de proteínas. Ahora, un estudio de genómica comparativa ha permitido generar el mapa genético más preciso y completo del virus.
Hecho por investigadores del Instituto de Tecnología de Massachusetts (MIT) y publicado este martes (11.05.2021) en la revista Nature Communications.
Mapa genómico del SARS-CoV-2
El estudio ha confirmado varios genes codificadores de proteínas y ha descubierto que otros -que se habían propuesto como genes no codificaban ninguna proteína.
«Pudimos utilizar este potente enfoque de genómica comparativa de firmas evolutivas; para descubrir el verdadero contenido funcional de codificación de proteínas de este genoma de enorme importancia», destaca Manolis Kellis, autor principal del estudio.
En una segunda parte del estudio, el equipo de investigación también analizó cerca de 2.000 mutaciones que han surgido en el SARS-CoV-2 desde el inicio de la pandemia, lo que les permitió evaluar la importancia que pueden tener esas mutaciones y su capacidad para evadir el sistema inmunitario o volverse más infeccioso.
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Genómica comparativa
Para determinar qué partes del genoma del SARS-CoV-2 contiene realmente genes, los investigadores recurrieron a la genómica comparativa; y compararon el SARS-CoV-2 con el SARS-CoV y 42 cepas de sarbecovirus de murciélagos.
Así, confirmaron seis genes codificadores de proteínas en el genoma del SARS-CoV-2, además de los cinco que están bien establecidos en todos los coronavirus.
Los investigadores también demostraron, que otras cinco regiones que se habían propuesto como posibles genes no codifican proteínas funcionales; y descartaron que queden otros por descubrir.
En el estudio, los investigadores también analizaron más de 1.800 mutaciones que han surgido en el SARS-CoV-2 y descubrieron que, en la mayoría de los casos; los genes que evolucionaron rápidamente antes de la pandemia han seguido haciéndolo.
Asimismo, analizaron las mutaciones que han surgido en variantes preocupantes, como la cepa británica, la de Brasil y la de Sudáfrica; y observaron que muchas de las mutaciones que hacen que esas variantes sean más peligrosas se encuentran en la proteína de la espiga, que ayuda al virus a propagarse con rapidez y a evitar el sistema inmunitario.
Cada una de esas variantes tiene, «más de 20 mutaciones más, y es importante saber cuáles de ellas pueden hacer algo y cuáles no», advierte Irwin Jungreis; autor principal del estudio e investigador del MIT.
Para los autores estos datos podrían ayudar a otros científicos a centrar su atención en las mutaciones que parecen tener efectos más significativos en la infectividad del virus.
